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Come aprire file .SW su Android

Per aprire file .SW su Android, android in genere non identifica correttamente .sw; spostare il file su un desktop per determinare se si tratta di file flat di testo UniProt/Swiss-Prot o audio PCM non elaborato e aprirlo con gli strumenti adatti (editor di testo/strumenti bio rispetto all'importazione di audio non elaborato).

Istruzioni passo passo

  1. Android in genere non identifica correttamente .sw; spostare il file su un desktop per determinare se si tratta di file flat di testo UniProt/Swiss-Prot o audio PCM non elaborato e aprirlo con gli strumenti adatti (editor di testo/strumenti bio rispetto all'importazione di audio non elaborato).

Problemi comuni

Il file .sw si apre come “sconosciuto” o con l'app sbagliata

L'estensione .sw è ambigua (dati Swiss-Prot/UniProt rispetto a audio PCM non elaborato) e le associazioni di file del sistema operativo potrebbero associarla a un tipo MIME Swiss-Prot anche quando il contenuto è diverso.

  1. Aprire una copia in un editor di testo semplice: i file flat UniProt/Swiss-Prot sono record di testo leggibili; L'audio PCM grezzo non avrà l'aspetto del testo strutturato.
  2. Se è testo Swiss-Prot/UniProt, elaboralo con un parser compatibile con UniProt come il supporto SwissProt/“swiss” di Biopython; se è audio, importalo come PCM grezzo in uno strumento audio e imposta i parametri manualmente.

L'audio .sw non elaborato viene riprodotto come rumore o alla velocità errata

Il PCM grezzo non ha intestazione, quindi il lettore non può conoscere la frequenza di campionamento, il numero di canali o la codifica esatta; impostazioni errate producono rumore, distorsione o velocità di riproduzione errata.

  1. Reimporta il file come audio non elaborato e conferma che sia firmato PCM a 16 bit (come documentato per l'audio .sw).
  2. Provare la frequenza/canali di campionamento corretti dal flusso di lavoro di origine; se sconosciuto, prova le frequenze di campionamento comuni (ad esempio, 44100 o 48000 Hz) e mono vs stereo finché non suona bene.

Il parser bioinformatico fallisce o si ferma a metà file

I flat file Swiss-Prot/UniProt sono record strutturati; il troncamento o la formattazione non conforme possono causare errori nei parser.

  1. Verificare che il download/trasferimento sia stato completato e che il file non sia troncato.
  2. Convalidare rispetto alla documentazione in formato file flat di UniProt e riesportare/scaricare nuovamente dalla fonte originale, se possibile.

Linux mostra il tipo MIMEchemical/x-swissprot ma il file non contiene dati UniProt

Su Linux, shared-mime-info può associare estensioni con tipi MIME utilizzando le regole installate; questo è basato sull'estensione e potrebbe non riflettere il contenuto effettivo.

  1. Ispeziona il contenuto del file (testo o binario) anziché fare affidamento solo sull'etichetta MIME.
  2. Se necessario, aprilo con un'app che ti consenta di scegliere esplicitamente "importa audio non elaborato" o "apri come testo", a seconda di cosa contiene effettivamente il file.

Nota di sicurezza

I file flat Swiss-Prot/UniProt sono dati di testo semplice, ma li trattano come input non attendibili per script e parser: un file non valido può innescare bug o un uso eccessivo delle risorse negli strumenti a valle (ad esempio, parser).

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