Come aprire file .SD su Linux
Per aprire file .SD su Linux, installa uno strumento che supporti MDL SD/SDF, come Open Babel (riga di comando "obabel").
Istruzioni passo passo
- Installa uno strumento che supporti MDL SD/SDF, come Open Babel (riga di comando "obabel").
- Apri o converti il file con Open Babel; I desktop Linux possono anche identificarlo tramite il database MIME condiviso a seconda dell'ambiente.
- Se hai solo bisogno di convalidare il contenuto, visualizzalo come testo per controllare i delimitatori dei record e i campi delle proprietà.
Problemi comuni
Il file .SD si apre come testo illeggibile o nell'app sbagliata
Un file SD è testo semplice, quindi il sistema operativo potrebbe utilizzare per impostazione predefinita un editor di testo anziché uno strumento di chimica e un editor di testo non visualizzerà le strutture.
- Aprilo con uno strumento chimico informatico che supporti MDL SD/SDF (ad esempio, Open Babel).
- Se il tuo flusso di lavoro prevede .sdf, converti il file in .sdf utilizzando un convertitore appropriato anziché rinominare l'estensione.
L'importazione non riesce o vengono caricate solo alcune molecole
I file SD possono contenere più record; gli importatori potrebbero fermarsi su un record non valido, tag imprevisti o variazioni non standard.
- Prova a leggere/convertire il file con Open Babel, che supporta MDL MOL/SD/SDF e spesso può gestire variazioni.
- Esamina il file come testo intorno al punto in cui si è verificato l'errore per cercare record troncati o separatori mancanti, quindi scarica nuovamente o riesporta il set di dati.
L'identificazione del tipo di file (MIME) non è coerente tra i sistemi
La mappatura del tipo MIME può variare in base alla piattaforma e all'ambiente desktop; Linux spesso fa affidamento sul database MIME condiviso di freedesktop e sulle sovrascritture locali.
- Su Linux, aggiorna o controlla il database delle informazioni mime condivise e le associazioni dei file se il tuo desktop identifica erroneamente i file .sd.
- Quando condividi file, considera l'utilizzo dell'estensione .sdf più esplicita se gli strumenti dei tuoi collaboratori lo prevedono.
Nota di sicurezza
Un file SD è costituito da dati (testo) e normalmente non è eseguibile, ma può comunque essere rischioso se aperto in parser chimici vulnerabili; aprire solo file SD da fonti attendibili con strumenti aggiornati.