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Come aprire file .RD su Linux

Per aprire file .RD su Linux, controllare il contenuto in un editor di testo per distinguere $RDFILE (RDfile chimico) dal markup della documentazione R .Rd.

Istruzioni passo passo

  1. Controllare il contenuto in un editor di testo per distinguere $RDFILE (RDfile chimico) dal markup della documentazione R .Rd.
  2. Per MDL RDfile: utilizzare gli strumenti chemioinformatici/CTfile disponibili nel flusso di lavoro in grado di leggere i formati RDfile/dati di reazione.
  3. Per R .Rd: aprire in un editor di testo o eseguire gli strumenti di documentazione R per analizzare/creare l'output della guida.

Problemi comuni

Il file .rd si apre come testo illeggibile o "incomprensibile"

Ciò accade spesso quando si apre un file MDL RD in un editor di testo di base senza uno strumento chimico che comprenda la struttura dei record CTfile o quando ci si aspettava un file R .Rd ma si riceveva un file RD chimico (o viceversa).

  1. Ispeziona l'inizio del file: cerca un'intestazione $RDFILE per confermare un RDfile MDL; I file R .Rd sembrano documentazione di testo semplice con markup/macro.
  2. Se si tratta di un file MDL RD, utilizzare il software CTfile/cheminformatica destinato ai formati RDfile/dati di reazione.
  3. Se si tratta di un file R .Rd, utilizzare gli strumenti di documentazione R (o visualizzarlo come testo).

L'app sbagliata è associata a .rd/.Rd sul tuo sistema

Poiché .rd è ambiguo, il tuo sistema operativo potrebbe associarlo a un programma non correlato, causando il fallimento del doppio clic o l'apertura nello strumento sbagliato.

  1. Utilizza "Apri con..." e scegli l'applicazione corretta per il contenuto effettivo del tuo file (strumento MDL RDfile rispetto a editor di testo/strumenti R).
  2. Se necessario, modifica l'associazione predefinita solo dopo aver confermato il tipo di file .rd che gestisci generalmente.

Nel file mancano reazioni/campi dati o l'importazione non riesce

I file RD sono basati su record e possono essere sensibili al troncamento, ai problemi di codifica o ai trasferimenti parziali; gli importatori possono anche aspettarsi convenzioni CTfile specifiche descritte nelle specifiche.

  1. Scaricare nuovamente o riesportare il file dal sistema originale per escludere corruzione/troncamento.
  2. Convalidare la struttura del file rispetto ai riferimenti RDfile (ad esempio, presenza di $RDFILE e struttura del record prevista) e provare uno strumento diverso compatibile con CTfile, se disponibile.

Nota di sicurezza

Tratta i file MDL RD come input non attendibili quando provengono dall'esterno della tua organizzazione: vengono analizzati da software di chimica specializzato e i file malformati possono innescare bug nei parser di file.

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