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Come aprire file .ASN su Windows

Per aprire file .ASN su Windows, se il file proviene da NCBI Pathogen Detection, table2asn o da un altro flusso di lavoro biologico NCBI, installalo e aprilo con NCBI Genome Workbench.

Istruzioni passo passo

  1. Se il file proviene da NCBI Pathogen Detection, table2asn o da un altro flusso di lavoro biologico NCBI, installalo e aprilo con NCBI Genome Workbench.
  2. Se si tratta di un file .asn di archivio BLAST, utilizzare NCBI BLAST+ blast_formatter per convertirlo in un formato di report BLAST leggibile.
  3. Se hai solo bisogno di ispezionare il file, prova un editor di testo; se il contenuto sembra illeggibile, è probabile che sia codificato e necessiti dello strumento NCBI appropriato.

Metodi alternativi

  • Open .ASN in a browser-based viewer if desktop apps fail.
  • Try opening .ASN on Windows with a secondary app to rule out app-specific issues.
  • Convert .ASN only with trusted tools when direct opening is not possible.

Problemi comuni

Il file .asn si apre come testo o simboli illeggibili

Non tutti i file ASN.1 sono testo semplice. Alcuni sono dati codificati destinati a uno specifico parser o strumento NCBI.

  1. Conferma l'origine del file, ad esempio BLAST, rilevamento di agenti patogeni o un flusso di lavoro di invio a GenBank.
  2. Utilizza lo strumento di corrispondenza: Genome Workbench per i file ASN.1 biologici NCBI supportati o blast_formatter per l'output dell'archivio BLAST.
  3. Evitare di modificare manualmente i file ASN.1 codificati in un editor di testo.

Genome Workbench non apre il file correttamente

Il file potrebbe non essere il tipo di dati NCBI ASN.1 previsto da Genome Workbench oppure potrebbe essere incompleto o danneggiato.

  1. Scarica nuovamente o riesporta il file dallo strumento NCBI o dall'origine dati originale.
  2. Controlla se il file è effettivamente un archivio BLAST, che dovrebbe invece essere gestito con blast_formatter.
  3. Assicurati di utilizzare una versione corrente del software NCBI pertinente.

Il file è un archivio BLAST .asn, non un normale report

L'output dell'archivio BLAST viene salvato come ASN.1 ed è pensato per essere riformattato in seguito anziché essere letto direttamente.

  1. Installare le applicazioni della riga di comando NCBI BLAST+.
  2. Utilizzare blast_formatter con l'archivio .asn come input e selezionare un formato di output come un formato di report BLAST supportato a coppie, tabulare, XML o altro.
  3. Conservare l'archivio .asn originale se in seguito potrebbe essere necessario generare formati di report diversi.

Il file non funziona dopo la ridenominazione

La modifica dell'estensione da o verso .asn non converte i dati o la codifica sottostanti.

  1. Ripristina il nome file originale se lo hai modificato.
  2. Utilizza una funzionalità di esportazione o conversione dal software che ha creato il file.
  3. Chiedere al mittente quale programma o flusso di lavoro NCBI ha prodotto il file.

Nota di sicurezza

I file .asn sono normalmente file di dati, non documenti abilitati per le macro, ma dovrebbero comunque essere aperti solo con software affidabile e aggiornato compatibile con ASN.1 perché i parser complessi possono fallire su dati non validi.

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