So öffnen Sie .SD-Dateien unter Mac
Um .SD-Dateien unter Mac zu öffnen, installieren Sie ein Tool, das MDL SD/SDF unterstützt, z. B. Open Babel (Befehlszeile „obabel“).
Schritt-für-Schritt-Anleitung
- Installieren Sie ein Tool, das MDL SD/SDF unterstützt, z. B. Open Babel (Befehlszeile „obabel“).
- Verwenden Sie Open Babel, um die .sd-Datei in ein anderes Format zu öffnen/konvertieren, das Ihr Workflow erwartet (z. B. .sdf, .mol, .smi).
- Zur schnellen Fehlerbehebung öffnen Sie es in einem Texteditor, um sicherzustellen, dass es wie eine SD-Datei aussieht (Strukturblock plus getaggte Datenfelder).
Häufige Probleme
Die .SD-Datei wird als unleserlicher Text oder in der falschen App geöffnet
Eine SD-Datei besteht aus reinem Text, daher verwendet das Betriebssystem möglicherweise standardmäßig einen Texteditor anstelle eines Chemie-Tools, und ein Texteditor visualisiert keine Strukturen.
- Öffnen Sie es mit einem Cheminformatik-Tool, das MDL SD/SDF unterstützt (z. B. Open Babel).
- Wenn Ihr Workflow .sdf erwartet, konvertieren Sie die Datei mit einem geeigneten Konverter in .sdf, anstatt die Erweiterung umzubenennen.
Der Import schlägt fehl oder es werden nur einige Moleküle geladen
SD-Dateien können mehrere Datensätze enthalten; Importeure stoppen möglicherweise aufgrund eines fehlerhaften Datensatzes, unerwarteter Tags oder nicht standardmäßiger Variationen.
- Versuchen Sie, die Datei mit Open Babel zu lesen/konvertieren, das MDL MOL/SD/SDF unterstützt und oft mit Variationen umgehen kann.
- Untersuchen Sie die Datei als Text rund um die Fehlerstelle, um nach abgeschnittenen Datensätzen oder fehlenden Trennzeichen zu suchen, und laden Sie dann den Datensatz erneut herunter oder exportieren Sie ihn erneut.
Die Dateitypidentifizierung (MIME) ist systemübergreifend inkonsistent
Die MIME-Typzuordnung kann je nach Plattform und Desktop-Umgebung variieren; Linux verlässt sich häufig auf die gemeinsam genutzte MIME-Datenbank von freedesktop und lokale Überschreibungen.
- Aktualisieren oder überprüfen Sie unter Linux Ihre Shared-Mime-Info-Datenbank und Dateizuordnungen, wenn Ihr Desktop .sd-Dateien falsch identifiziert.
- Erwägen Sie beim Teilen von Dateien die Verwendung der expliziteren Erweiterung .sdf, wenn die Tools Ihrer Mitarbeiter dies erwarten.
Sicherheitshinweis
Eine SD-Datei besteht aus Daten (Text) und ist normalerweise nicht ausführbar. Sie kann jedoch dennoch riskant sein, wenn sie in anfälligen Chemie-Parsern geöffnet wird. Öffnen Sie SD-Dateien nur aus vertrauenswürdigen Quellen in aktuellen Tools.